まず送料について、個人輸入の場合には現地から一つずつ発送するため割高となるケースが多くなります。（個人輸入代行サービスの場合も同様となります。）
個人輸入の場合には、商品そのものがそもそも日本で使って良いものなのかの判断を、購入者自身で行う必要があり、多くの場合個人輸入代行サービスは何らの責任も持たない・問われない形となります。
また、注文した商品が届かない、あるいは届いた商品に不良があった場合など、全て現地のメーカーとのやりとりを自分で行う必要があります。
さらに、関税や消費税などを受取時に支払わなければいけないケースもあり、必ずしも商品購入時に支払った金額だけで済まない場合もある点は注意する必要があります。